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耀杰不凡丨第二刊：“肛拭子”頻頻上熱門？伯杰醫(yī)療邀你一起知其所以然

近日，采集“肛拭子樣本”用于新冠篩查的新聞成為大家熱議的焦點(diǎn)，事件的起因是1月20日

2022-02-21


“耀杰不凡”致敬幕后抗疫英雄推文解讀活動(dòng)


第二刊：“肛拭子”頻頻上熱門？伯杰醫(yī)療邀你一起知其所以然


近日，采集“肛拭子樣本”用于新冠篩查的新聞成為大家熱議的焦點(diǎn)，事件的起因是1月20日，北京新冠防控新聞發(fā)布會(huì)介紹，其已對(duì)大興某新發(fā)病例所在學(xué)校全體學(xué)生、教職工等全部進(jìn)行鼻咽拭子、口咽拭子、肛拭子及血清檢測。

那么問題來了，此次北京大興為什么在篩查中增加了“肛拭子”檢測？其實(shí)，有關(guān)樣本類型檢出率這一議題，早先便有眾多學(xué)者對(duì)其進(jìn)行過討論。2020年8月公布的《新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第八版)》中也明確表示，可以在糞便、尿液中可分離到新冠病毒。

今天，筆者就帶大家一同解析來自深圳市第三人民醫(yī)院的劉映霞教授、劉磊教授與來自中科院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院的李亮教授團(tuán)隊(duì)的對(duì)該議題產(chǎn)生的探討。深圳三院在疫情期間，第一時(shí)間“全員動(dòng)員、全域作戰(zhàn)”，在深圳抗疫的戰(zhàn)場中全力投入，更是首次在全國率先從確診患者糞便中檢測出新冠病毒核酸陽性。

本期研究主題：新冠肺炎患者腸道排毒特征規(guī)律及不同標(biāo)本病毒脫落情況研究

鼻咽拭子、口咽拭子、痰液、支氣管灌洗液及肛拭子這些不同類型的標(biāo)本與檢測結(jié)果之間到底存在著什么樣的聯(lián)系呢？不同的病程進(jìn)展情況下，上述各樣本類型是否存在檢出差異？且聽大咖見解，一一道來~

解讀文獻(xiàn)1：《The Time Sequences of Oral and Fecal Viral Shedding of Coronavirus Disease 2019(COVID-19) Patients》

本研究成果由深圳市第三人民醫(yī)院的劉映霞教授、劉磊教授和中科院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院的李亮教授團(tuán)隊(duì)在2020年5月16日發(fā)表于胃腸病學(xué)和肝病專業(yè)領(lǐng)域國際排名第一的醫(yī)學(xué)雜志《胃腸病學(xué)（Gastroenterology）》，研究主題為新冠肺炎患者的腸道排毒特征及規(guī)律。



本研究持續(xù)對(duì)深圳三院住院的401名實(shí)驗(yàn)室確診的COVID-19患者糞便及呼吸道樣本中的病毒核酸進(jìn)行監(jiān)測，跟蹤隨訪長達(dá)三個(gè)月以上， 研究發(fā)現(xiàn)此次SARS-CoV-2在感染早期（病程第1周）從腸道排出的陽性率最高（44.19%），而2003年的SARS病毒在腸道的檢出率通常需要在2~3周時(shí)才能達(dá)到高峰。隨著病程進(jìn)展，SARS-CoV-2在糞便中病毒核酸的陽性率逐步下降，在病程的4~5周形成一個(gè)平臺(tái)期。通過對(duì)患者的臨床資料分析，在病程的3~5周時(shí)，大部分患者臨床癥狀已消失，各項(xiàng)指標(biāo)達(dá)到了出院標(biāo)準(zhǔn)，但仍有12%的患者糞便可以持續(xù)排毒，提示對(duì)于康復(fù)期患者仍需加強(qiáng)糞便管理，防止糞口傳播。研究發(fā)現(xiàn)在病程第7周時(shí)仍然有2例患者糞便核酸陽性，但病程7周以上的患者（共篩檢303例）的糞便病毒核酸未再檢出陽性。（見圖1）



圖1. 患者糞便中 SARS-CoV-2在病程不同時(shí)間（周）的檢測情況。


研究同時(shí)還收集了糞便病毒核酸陽性的患者配對(duì)的呼吸道樣本，共517對(duì)（同一天采集的糞便和呼吸道樣本），結(jié)果發(fā)現(xiàn)29.8%(111對(duì))的患者糞便病毒RNA檢測呈陽性，而呼吸道樣本中呈陰性，這表明在呼吸道中病毒被清除后，病毒仍有可能在腸道中復(fù)制，仍有可能會(huì)發(fā)生糞口傳播的風(fēng)險(xiǎn)。當(dāng)兩類樣本同時(shí)陽性時(shí)，糞便樣本病毒載量普遍較呼吸道樣本高，提示對(duì)糞便樣本的病毒核酸檢測，有助于提高新冠病毒感染的陽性率。

研究還發(fā)現(xiàn)兒童新冠感染患者糞便的病毒陽性率遠(yuǎn)高于成人，提示要重視兒童新冠病毒感染患者糞便樣本的病毒核酸檢測和管理；同時(shí)發(fā)現(xiàn)胃腸道癥狀的存在似乎與糞便樣本病毒陽性無相關(guān)性，提示新冠病毒可能將腸道作為儲(chǔ)存和復(fù)制的場所，但尚未發(fā)現(xiàn)其對(duì)腸道功能的嚴(yán)重影響；此外，患者的中性粒細(xì)胞水平與病毒在糞便中持續(xù)時(shí)間呈正相關(guān)，而抗病毒治療啟動(dòng)時(shí)間與病毒在糞便中持續(xù)時(shí)間呈負(fù)相關(guān)，提示早期有效抗病毒治療也許能夠縮短SARS-CoV-2在腸道存在時(shí)間。


解讀文獻(xiàn)2：Laboratory Diagnosis and Monitoring the Viral Shedding of SARS-CoV-2 Infection


本文由深圳市第三人民醫(yī)院國家傳染病臨床研究中心的劉映霞教授團(tuán)隊(duì)通過RT-PCR檢測分析了不同呼吸道標(biāo)本，并對(duì)比了新冠患者上呼吸道和下呼吸道之間的病毒脫落情況的差異。研究對(duì)不同時(shí)期、不同樣本的病毒載量提供了翔實(shí)的研究數(shù)據(jù)，從而提高了新冠檢測的準(zhǔn)確性。


樣本情況：


本期研究收集了410例患者的3,552份呼吸道標(biāo)本，包括559份口咽拭子，2,231份鼻咽拭子，696份痰標(biāo)本和66 份支氣管肺泡灌洗液（BALF）樣本。在這些患者中，90例為重癥患者，320例為輕度和中度患者。

圖2. 患者狀況分布圖


不同呼吸道樣本中檢測新冠病原體

本期研究對(duì)發(fā)病后0-7天，8-14天和15天以上三個(gè)時(shí)間分別進(jìn)行了采樣。文章中的每個(gè)樣本均采用了上海伯杰醫(yī)療科技有限公司的新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測試劑盒（熒光PCR法）進(jìn)行檢測。結(jié)果表明，發(fā)病0-7天樣本中，痰樣本的陽性率最高，其次是鼻咽拭子，然后是口咽拭子。在發(fā)病8-14天中，痰樣本也顯示出了最高的陽性率。而在15天以后，幾種樣本的陽性率基本持平。在0-7天和8-14天兩組中，重癥患者的支氣管肺泡灌洗液的陽性率為100%，但是輕度患者為陰性。15天后，重癥患者的支氣管肺泡灌洗液的陽性率依舊高達(dá)63.8%。并且隨著時(shí)間的增長，病毒載量和陽性率會(huì)逐漸降低。


上，下呼吸道的不同檢測結(jié)果

實(shí)驗(yàn)收集了21名新冠患者的上，下呼吸道樣本。在重癥患者中，RNA病毒能在大部分上呼吸道樣本中被檢測到。支氣管肺泡灌洗液樣本中的RNA病毒最早在第4天被發(fā)現(xiàn)，但重癥病例的Ct值較低。盡管病毒RNA在部分上呼吸道樣本中顯陰性，但在支氣管肺泡灌洗液樣本中會(huì)顯出陽性。相反，在輕度患者中，僅在上呼吸道檢測出了RNA病毒，而未在支氣管肺泡灌洗液樣本中檢測到。

圖3. RNA病原體的檢測狀況


結(jié)論：

1.多種樣本檢測結(jié)果互為補(bǔ)充，能夠有效防止漏檢：根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果，新冠不同疾病程度患者的痰樣本、鼻咽拭子、口咽拭子陽性率不同，痰液的檢出率相對(duì)較高。

2.重癥病例上呼吸道樣本檢出率低，需聯(lián)合其他輔助手段：經(jīng)過上，下呼吸道的樣本檢測，一些重癥病例的上呼吸道樣本中未檢測出病毒RNA但在痰液樣本中顯示為陽性。由此可見，盡管未在上呼吸道樣本中檢測到病毒RNA，但不應(yīng)將那些具有接觸史和臨床癥狀的可疑病例排除。在這種情況下，CT掃描可能為診斷COVID-19提供重要證據(jù)。


3.下呼吸道病毒脫落時(shí)間更長：研究發(fā)現(xiàn)，下呼吸道的病毒脫落時(shí)間可持續(xù)長達(dá)46天，這比先前發(fā)現(xiàn)的上呼吸道樣本的病毒脫落時(shí)間更長。在制定治療和抗擊病毒傳播的策略時(shí)，應(yīng)謹(jǐn)慎對(duì)待新冠病毒的異常病毒脫落情況。

圖4. RNA病毒的脫落持續(xù)時(shí)長


綜上所述，兩篇文章中均探討了針對(duì)不同樣本類型的新冠陽性檢出率。痰液的檢出率相對(duì)較高，但是除呼吸道樣本外糞便檢測也可以作為呼吸道樣本檢測很好補(bǔ)充。當(dāng)下疫情的重點(diǎn)之一，在于篩查出初期及無癥狀感染者，而多樣化的取樣送檢，可以有效地提高檢出率避免漏檢。


本文中所提及的學(xué)術(shù)研究所使用的檢測試劑，來自于上海伯杰醫(yī)療科技有限公司的新型冠狀病毒2019-nCoV核酸檢測試劑盒（熒光PCR法）。此番能夠在科研合作中出一份力，伯杰醫(yī)療深感榮幸。成立以來，伯杰醫(yī)療一直專注于傳染性病原體的診斷，秉承“勇于創(chuàng)新，質(zhì)量為先”的方針。助力檢驗(yàn)科研事業(yè)的發(fā)展，伯杰醫(yī)療責(zé)無旁貸！


參考文獻(xiàn)：

1. Zhu, N., Zhang, D., Wang, W., et al. (2020). A novel coronavirus from patients with pneumonia in China, 2019. N. Engl. J. Med. 382, 727–733.

2. Tan, W., Zhao, X., Ma, X., et al. (2020). A novel coronavirus genome identified in a cluster of pneumonia cases—Wuhan, China 2019–2020. China CDC Weekly 2, 61–62.

3. Xu, X.W., Wu, X.X., Jiang, X.G., et al. (2020). Clinical findings in a group of patients infected with the 2019 novel coronavirus (SARS-Cov-2) outside of Wuhan, China: retrospective case series. BMJ 368, m606, https://doi.org/10.1136/bmj.m606.

4. Wang, D., Hu, B., Hu, C., et al. (2020). Clinical characteristics of 138 hospitalized patients with 2019 novel coronavirus-infected pneumonia in Wuhan, China. JAMA 323, 1061–1069.

5. Huang, C., Wang, Y., Li, X., et al. (2020). Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. Lancet 395, 497–506.

6. Guan, W.J., Ni, Z.Y., Hu, Y., et al. (2020). Clinical characteristics of coronavirus disease 2019 in China. N. Engl. J. Med. 382, 1708–1720.

7. Chan, J.F., Yuan, S., Kok, K.H., et al. (2020). A familial cluster of pneumonia associated with the 2019 novel coronavirus indicating person-to-person transmission: a study of a family cluster. Lancet 395, 514–523.

8. Xu, Z., Shi, L., Wang, Y., et al. (2020). Pathological findings of COVID-19 associated with acute respiratory distress syndrome. Lancet Respir. Med. 8, 420–422.

9. Rothe, C., Schunk, M., Sothmann, P., et al. (2020). Transmission of 2019-nCoV infection from an asymptomatic contact in Germany. N. Engl. J. Med. 382, 970–971.

10. Phan, L.T., Nguyen, T.V., Luong, Q.C., et al. (2020). Importation and human-to-human transmission of a novel coronavirus in Vietnam. N. Engl. J. Med. 382, 872–874.

12. Lei, J., Li, J., Li, X., et al. (2020). CT imaging of the 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) pneumonia. Radiology 295, 18.

13. Li, Q., Guan, X., Wu, P., et al. (2020). Early transmission dynamics in Wuhan, China, of novel coronavirus-infected pneumonia. N. Engl. J. Med. 382, 1199–1207.

14. Mackay, I.M., and Arden, K.E. (2015). MERS coronavirus: diagnostics, epidemiology and transmission. Virol. J. 12, 222, https://doi.org/10.1186/s12985-015-0439-5.

15. Chan, P.K.S., To, W.K., Ng, K.C., et al. (2004). Laboratory diagnosis of SARS. Emerg. Infect. Dis. 10, 825–831.

16. Zhang, W., Du, R.-H., Li, B., et al. (2020). Molecular and serological investigation of 2019-nCoV infected patients: implication of multiple shedding routes. Emerg. Microbes Infect. 9, 386–389.

17. Zhang, J., Wang, S., and Xue, Y. (2020). Fecal specimen diagnosis 2019 novel coronavirus- infected pneumonia. J. Med. Virol. 92, 680–682.

18. Xiao, F., Tang, M., Zheng, X., et al. (2020). Evidence for gastrointestinal infection of SARS-CoV-2. Gastroenterology 158, 1831–1833.e3.

19. Wang, W., Xu, Y., Gao, R., et al. (2020). Detection of SARS-CoV-2 in different types of clinical specimens. JAMA 323, 1843–1844.

20. Ling, Y., Xu, S., Lin, Y., et al. (2020). Persistence and clearance of viral RNA in 2019 novel coronavirus disease rehabilitation patients. Chin Med. J. (Engl). 133, 1039–1043.

21. Cai, J., Xu, J., Lin, D., et al. (2020). A case series of children with 2019 novel coronavirus infection: clinical and epidemiological features. Clin. Infect. Dis. 71, 1547–1551.

22. Xu, D., Zhang, Z., Jin, L., et al. (2005). Persistent shedding of viable SARS-CoV in urine and stool of SARS patients during the convalescent phase. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 24, 165–171.

23. Zhao, F., Yang, Y., Wang, Z., et al. (2020). The time sequences of oral and fecal viral shedding of coronavirus disease 2019 (COVID-19) patients. Gastroenterology 159, 1158–1160.

24. Yao, X., He, Z., Li, T., et al. (2020). Pathological evidence for residual SARS-CoV-2 in pulmonary tissues of a ready-for-discharge patient. Cell Res. 30, 541–543.

25. Chan, J.F.W., Lau, S.K.P., To, K.K.W., et al. (2015). Middle East respiratory syndrome coronavirus: another zoonotic betacoronavirus causing SARS-like disease. Clin. Microbiol. Rev. 28, 465–522.

26. Cheng, V.C.C., Lau, S.K.P., Woo, P.C.Y., et al. (2007). Severe acute respiratory syndrome coronavirus as an agent of emerging and reemerging infection. Clin. Microbiol. Rev. 20, 660–694.

27. He, X., Lau, E.H.Y., Wu, P., et al. (2020). Temporal dynamics in viral shedding and transmissibility of COVID-19. Nat. Med. 26, 672–675.

28. Zhou, F., Yu, T., Du, R., et al. (2020). Clinical course and risk factors for mortality of adult inpatients with COVID-19 in Wuhan, China: a retrospective cohort study. Lancet 395, 1054–1062.

29. Yang, Y., Shen, C., Li, J., et al. (2020). Plasma IP-10 and MCP-3 levels are highly associated with disease severity and predict the progression of COVID-19. J. Allergy Clin. Immunol. 146, 119–127.e4.

30. Yang, Y., Wong, G., Yang, L., et al. (2019). Comparison between human infections caused by highly and low pathogenic H7N9 avian influenza viruses in Wave Five: clinical and virological findings. J. Infect. 78, 241–248.

31. Bi, Y., Tan, S., Yang, Y., et al. (2019). Clinical and immunological characteristics of human infections with H5N6 avian influenza virus. Clin. Infect. Dis. 68, 1100–1109.

32. Liu, Y., Zhang, C., Huang, F., et al. (2020). Elevated plasma level of selective cytokines in COVID-19 patients reflect viral load and lung injury. Natl. Sci. Rev. 7, 1003–1011.





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