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目前，新冠病毒的頻繁變異引起人們對于核酸檢測試劑有效性的擔憂。針對這一問題，伯杰已迅速行動，完成對現(xiàn)有新冠病毒熒光PCR檢測試劑引物探針與國際上最新突變株（包含但不限于英國B 1.1.7突變株）的核對，結(jié)果證實不會脫靶和漏檢，仍可保證檢測試劑的準確性和靈敏性。
日本厚生勞動省25日稱，日本國內(nèi)首次確診感染變異新冠病毒的患者。日本國立感染癥研究所病原體基因解析研究中心的解析結(jié)果顯示，男女5人感染的新冠病毒與突變株的遺傳基因一致。感染者5人均有滯留英國經(jīng)歷，其中4人為無癥狀患者，另1名60多歲男性，出現(xiàn)倦怠感的癥狀。
日本首都東京周五新增新冠肺炎確診病例884例，連續(xù)兩天突破800例，重癥患者81人，創(chuàng)下緊急事態(tài)宣言后新高。日本各地疫情嚴峻，周四全國確診人數(shù)達到3740人，創(chuàng)下過去新高。
此次感染的變異新冠病毒是來自于英國本月14日和23日宣布發(fā)現(xiàn)的兩種變異株。S蛋白與人ACE2受體結(jié)合親和力提高了1000倍，傳播速度比之前的毒株高達70%；很快就成為了倫敦地區(qū)的主要流行株。英國為此也采取了更為嚴格的禁令。
英國新毒株的出現(xiàn)
英國出現(xiàn)的新冠突變株（B.1.1.7）引發(fā)了人們的恐慌，該毒株于首次在2020年9月20日，英國東南部出現(xiàn)，并處于獨立的進化分支上。
圖1：B.1.1.7的系統(tǒng)發(fā)育樹及突變位點
倫敦大學國王學院病毒學家斯圖亞特·尼爾 （ Stuart Neil） 表示，幾周前這種變異病毒只與10%~15%的病例有關(guān)，而在上周已占到倫敦病例的60%，計算機模型顯示，該病毒的傳染性可能比其他毒株高出56%。目前，該毒株已在德國，法國，意大利，丹麥，荷蘭，澳大利亞，約旦，日本，韓國和新加坡等國家和地區(qū)相繼出現(xiàn)。
圖2：B.1.1.7在英國新冠病毒基因組序列中的占比變化
（注：B.1.1.7也被命名為VUI202012/01）
就英國最近報告的突變株，世衛(wèi)組織官員在21日舉行的記者會上表示，目前掌握的情況顯示，英國出現(xiàn)的這種病毒變種傳播性更強，病毒基本再生數(shù)(R0)從1.1提高到1.5，但是病人癥狀、重癥率、死亡率基本沒有變化，當前研發(fā)的疫苗仍然有效。目前對該變種仍在繼續(xù)研究，但是基本的防控措施是一樣的，應該進一步加大防控措施，嚴格實施綜合防控措施，新冠病毒仍然可以得到控制。
英國新毒株有什么特別之處
B.1.1.7是一個有23個突變位點的毒株，其中17個為非同義突變，6個為同義突變。17個非同義突變中包括14個點突變和3個缺失突變，分別位于ORF1ab基因（4個），N基因（2個），ORF8基因（3個）和S（Spike）基因（8個）。其中，位于S基因上的突變提示該毒株在與宿主細胞的相互作用上可能存在變化。6個同義突變（其中5個位于ORF1ab上）提示該毒株存在適應性進化。該毒株有3個位于S基因上的關(guān)鍵突變，具有潛在的生物學功能，其中，最主要的突變?yōu)槲挥?/span>S基因上的N501Y突變。
2.1 N501Y: 這個位于S蛋白受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域（Receptor-Binding Domain，RBD）上的關(guān)鍵6個氨基酸之一的突變提高了病毒與宿主蛋白AEC2受體的親和力（Starr et al. 2020；Gu et al. 2020），且已在小鼠模型上證明，該突變大大增加了RBD與受體ACE2的親和力，能使本來不感染小鼠的新冠病毒毒株變得能夠感染小鼠（Gu et al. 2020）。值得一提的是，該突變也存在于501Y.V2中，這是南非研究人員在對三個沿海省份迅速暴發(fā)的疫情進行調(diào)查后發(fā)現(xiàn)的新冠病毒變體。
2.2 69-70del：這個位于S蛋白上的缺失突變有助于病毒逃逸宿主的免疫應答，并且也與受體結(jié)合結(jié)構(gòu)域的改變相關(guān)（McCarthy et al. 2020；Kemp et al. 2020）。例如，有研究表明，69-70del突變會逃逸一些單克隆抗體的中和作用，也可能會降低部分血清的中和敏感性。這一變體最早在7月份出現(xiàn)，英國、荷蘭、澳大利亞也均出現(xiàn)過，后來在丹麥的水貂中頻繁出現(xiàn)而引起廣泛關(guān)注，其中在水貂中常伴隨Y453F共同出現(xiàn)，而在人類中則常伴隨N439K共同出現(xiàn)。
2.3 P681H：該位點是S蛋白中連接S1和S2的4個關(guān)鍵氨基酸，該突變可導致形成弗林蛋白酶(Furin)裂解位點，該裂解位點對新冠病毒感染宿主細胞至關(guān)重要，能夠使得其易被蛋白酶切割，從而增強其與AEC2受體的親和力，促進病毒進入呼吸道上皮細胞（Hoffmann, Kleine-Weber, and P?hlmann 2020；Peacock et al. 2020; Zhu et al. 2020）
圖3：S蛋白及其關(guān)鍵突變位點
此外，位于非S基因區(qū)域的ORF8 Q27終止子突變截短了ORF8蛋白，從而導致下游突變的累計。如新加坡毒株就含有此突變（Young et al. 2020）。
目前為止，新冠病毒通常每個月只能獲得1到2個位點上的突變?？茖W家們認為B.1.1.7的變異可能也是符合這一節(jié)奏的，它的變異也許不比其他譜系更快，但其累計突變多，提示其可能已經(jīng)存在了很長時間。科學家們推測，該毒株很可能產(chǎn)生在一名慢性感染患者體內(nèi)，經(jīng)歷了漫長的進化過程，并在感染的后期才對外傳播了該毒株。
B.1.1.7傳播力強已成既定事實，針對這一毒株，多國已采取管控措施。
12月20日，荷蘭首先宣布對英旅行禁令，將至少持續(xù)至2021年1月1日。此外，德國、愛爾蘭、比利時、奧地利、瑞士、葡萄牙、芬蘭、克羅地亞、保加利亞、意大利、瑞典、羅馬尼亞、愛沙尼亞、拉脫維亞、立陶宛、加拿大、印度、以色列、伊朗、沙特阿拉伯、土耳其、摩洛哥、薩爾瓦多、哥倫比亞和科威特等國也宣布了不同程度的對英旅行禁令。
與英國隔海相對的法國，則從12月20日23時 （GMT） 起暫停來自英國的客運和貨運48小時。此決定也將影響連接英國肯特郡與法國的海底隧道，該隧道通行歐洲之星火車和英國進口食品及日常用品的貨車。
我國也已對英國實施航班禁令，12月24日，中國外交部宣布暫停中英往返航班。
而就目前防控形勢而言，中國疾病預防控制中心副主任馮子健在12月25日接受中新社專訪時表示，從中國目前所獲得的病毒序列看，不管是輸入人員、貨物還是冷鏈產(chǎn)品等，從各種途徑獲得的病毒，都沒有發(fā)現(xiàn)已有變異病毒輸入。但形勢依然嚴峻，中國疾控中心一方面嚴密關(guān)注英國和歐洲，甚至全球變異病毒傳播的情況，另一方面再進一步檢視現(xiàn)行防控措施。
結(jié)合此前多國學者發(fā)現(xiàn)的D614突變病株（詳見干貨分享第七期: 揭開新冠病毒D614G突變的神秘面紗），新冠病毒的頻繁變異亦引起人們對于核酸檢測試劑有效性的擔憂。針對這一問題，伯杰已迅速行動，完成對現(xiàn)有新冠病毒熒光PCR檢測試劑引物探針與國際上最新突變株（包含但不限于英國B 1.1.7突變株）的核對，結(jié)果證實不會脫靶和漏檢，仍可保證檢測試劑的準確性和靈敏性。
參考文獻
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